派出机构管辖范围

梅山海事处：乌江河口与慈湖河口连线至梅子洲洲头垂直连线之间的长江两岸以及新生洲、新济洲、子母洲、邱汀洲、新潜洲环岛。

浦口海事处：梅子洲洲头垂直连线至南京长江大桥之间的长江两岸。

新生圩海事处：南京长江大桥至金扬码头下沿之间的长江南岸，草鞋峡水道八卦洲沿岸。

大厂海事处：宝塔水道及南京长江大桥至天河口下口之间的长江北岸，宝塔水道八卦洲沿岸。

栖霞海事处：金扬码头下沿至南京长江油运公司摄山基地下界之间的长江南岸，天河口下口至乌鱼洲锚地9#系船浮之间的长江北岸。

大厂海事处征洲办事处和仪化办事处：乌鱼洲锚地9#系船浮至南京海事局仪征值班待命点码头下游150米处间的长江北岸，张子港上塔形沿岸标至新河口塔形沿岸标之间的长江南岸。

龙潭海事处筹备组：南京长江油运公司摄山基地下界至张子港上塔形沿岸标之间的长江南岸。

大胜关长江大桥海事处：大胜关长江大桥8号浮与两岸的垂直连线至大胜关长江大桥1号浮与两岸垂直连线。

直属机构管辖范围

第一水上执法大队：乌江河口与慈湖河口连线至梅子洲洲头垂直连线水域。

第二水上执法大队：梅子洲洲头垂直连线至南京长江大桥桥区下界线之间水域和梅子洲、潜洲环岛陆域范围。

第三水上执法大队：南京长江大桥桥区下界线至乌鱼洲锚地9#系船浮与张子港上塔形沿岸标连线之间水域。

第四水上执法大队：乌鱼洲锚地9#系船浮与张子港上塔形沿岸标连线至十二圩测点与新河口塔形沿岸标连线之间水域。